El Término municipal de Zújar está situado entre las cordilleras subbéticas, en el denominado Altiplano Granadino. Su peculiar orografía se configura por su situación entre la Sierra de Baza al sur, la Hoya de Baza y la Sierra del Pozo al norte. La Villa de Zújar se encuentra en las faldas del Cerro Jabalcón, un monte aislado que alcanza una altitud de 1.496 m.
El término municipal presenta un conjunto de altiplanicies horadadas por la lenta acción del agua, que han conformado una red de barrancos y ramblas que descienden hacia el cauce del río Guadiana Menor, desde la derecha (estribaciones de la sierra del Pozo) y desde la izquierda (llanuras y estribaciones de la Sierra de Baza). En la actualidad este cauce está ocupado por el embalse del Negratín, confluencia de los elementos orográficos e hidrográficos del término municipal.
Además de terrenos pelados y secos, por su naturaleza calcárea, el núcleo de Zújar se sitúa en una zona de afloramiento de agua subterránea. Las numerosas fuentes han permitido la existencia de una frondosa vega desde tiempos inmemoriales. Las estribaciones del Cerro Jabalcón, en su cara norte, ofrecen un paraje de pinares, fruto de las repoblaciones de mediados del siglo XX. Hacia el norte, se asciende entre barrancos, ramblas y el cauce del río Guadalentín, en dirección a la Sierra del Pozo y de Cazorla. Se llega, así, al núcleo denominado Carramaiza, que se enclava en los llanos del mismo nombre, y se sigue ascendiendo hasta el límite con la provincia de Jaén.
Los paisajes del término municipal son únicos en la provincia de Granada debido al gran contraste provocado por la diversidad de sus parajes.
